贵阳职业技术学院现有5个特色分院（轨道交通分院、装备制造分院、磷煤化工分院、城乡规划建设分院、食品药品生产与检测分院）、10个系（城市轨道交通系、机电技术系、财政经贸系、信息科学系、旅游管理系、生化工程系、建筑工程系、艺术系、农林水技术系、资源勘查工程管理系）、2个市级中心（数控加工工程技术研究中心、农产品检测中心）、2个职业教育集团（磷煤化工职业教育集团、装备制造职业教育集团）、1个省级大师工作室，其他教学机构有基础教育部、中等职业教育部、思政教育部、继续教育部、培训部、实训中心等。