运动训练专业是福建体育职业技术学院的重点专业，是省级精品专业，设有乒乓球、羽毛球、网球、篮球、足球等多个专业教学团队方向。运动训练专业人才培养目标旨在服务当前我国体育服务体系建设，培养运动组织服务方面、运动指导服务、体育活动服务等方面的技能型、创业型人才。运动训练专业生源对象主要为通过单独招生考试吸纳的各地市体校学生、专业运动队运动员及具有较高体育特长的中学毕业生。运动训练专业承担着运动员职业教育及培养体育产业专门人才的双重任务，秉承“立足体育、服务行业、工学结合、实践育人”的定位，充分发挥行业和地区优势，创建体育专业品牌。历年来，运动训练专业学生在体育高职院校学生技能大赛、全省大学生联赛、单项运动赛事等全国性赛事活动中获得最高奖项。2015年，还获得由国家体育总局授予认定的“运动员职业指导工作室”。