基础医学专业依托基础医学院雄厚的师资力量和优越的软硬件平台，以导师制为育人模式，培养适应新世纪医学和生命科学发展需要，具有扎实的现代生命科学和医学的理论基础，较强的创新精神和实践能力，较好的外语和计算机应用能力，能够在高等医学院校和医学科研机构等部门从事基础医学教学与科学研究、基础与临床相结合的医学实验研究工作的医学高级专门人才。核心课程有人体解剖学、组织胚胎学、医学生物化学、基因工程原理与技术、生理学、细胞生物学、遗传学、基因组学与进化论、医学免疫学、病原生物学、药理学、病理学、病理生理学、内科学、外科学、放射医学、诊断学等。专业实验课程包括形态学实验、机能学实验、生物化学与分子生物学实验、细胞生物学实验、免疫学实验、病原生物学实验、实验动物学等。