东北师范大学目前有2个校区，分别是东北师范大学净月校区、自由校区。其中，净月校区位于吉林省长春市净月大街2555号；自由校区位于吉林省长春市人民大街5268号。
学校设有22个学院（部），81个本科专业，23个博士学位授权一级学科，37个硕士学位授权一级学科，1个博士专业学位授权点和22个硕士专业学位授权点，以及22个博士后科研流动站。学科点覆盖了除军事学和医学以外的11个学科门类，形成了层次分明、类型多样的人才培养体系。
近年来，学校学科建设工作取得历史性突破，2017年9月公布的国家“世界一流大学和一流学科建设高校及建设学科”中，马克思主义理论、世界史、数学、化学、统计学、材料科学与工程6个学科入选世界一流学科建设行列，入选数量位列全国第19位、211院校之首。
在教育部学位中心第四轮学科评估中，A类学科6个(其中马克思主义理论获评A+)，B类学科15个。34个学科入选吉林省特色高水平学科。学校现有药物基因和蛋白筛选1个国家工程实验室和14个部级重点研究基地，世界文明史研究中心、农村教育研究所2个教育部人文社会科学重点研究基地。