平行志愿投档的规则是“分数优先、遵循志愿、一次投档、不再补档”。平行志愿投档具有三个特点，一是每一批次每一阶段院校录取时，高考总分高的考生先于总分较低的考生投档;二是每个考生的平行院校志愿是有先后顺序的，计算机投档时按考生填报的院校志愿顺序依次进行检索;三是平行志愿实行“多次模拟，一次投档”，不补充投档。录取时，计算机系统先对同一科类、相应批次录取控制分数线上符合条件的考生按高考总分(含照顾政策)从高到低进行排序;然后从排序在第一位的考生开始，依次检索每位考生填报的几个院校志愿;若考生符合其中一所以上院校的投档条件时，则将考生的电子档案投到排序在前的院校;若考生只符合其中一所院校的投档条件，则将投档到该院校。
从平行志愿的投档规则可以看出，考生在选择院校志愿时，可以有多个选择机会，但按照公平性原则，在某一批次或某一阶段录取过程中，只有一次被投档的机会，考生电子档案一旦被投出，计算机系统不再检索该生的其他院校志愿。计算机系统一次性将所有院校的考生档案投出以后，如考生因身体条件、所报专业等不符合院校录取要求而被退档时，该考生的电子档案也不再投向本批次或本阶段的其他平行志愿院校，即平行志愿不补充投档。
平行志愿投档时，同分考生的投档规则是什么?
当若干名考生高考成绩总分相同(含照顾政策)但单科成绩不同时，计算机投档系统先分文理、按规定顺序科目的分数将总分相同考生进行排序(文史类同分考生的排序科目依次为“语文、数学、文科综合、外语”，理工类同分考生的排序科目依次为“语文、数学、理科综合、外语”)，然后按照考生排序从先到后的顺序，依次检索考生志愿，并按平行志愿投档规则进行投档。即，若干名高考成绩总分相同的考生中，语文成绩较高的考生排序在前，计算机投档系统先检索其志愿并按平行志愿投档规则进行投档;如语文成绩也相同，则按数学成绩排序，以此类推。