东北大学的王牌专业主要有控制科学与工程、网站工程、计算机科学与工程、材料科学、网站工程，计算机科学与工程和材料科学等。
东北大学国家级重点学科
材料物理与化学、材料学、材料加工工程、冶金物理化学、钢铁冶金、有色金属冶金、控制理论与控制工程、检测技术与自动化装置、系统工程、模式识别与智能系统、导航、制导与控制、机械设计及理论、科学技术哲学、计算机应用技术、采矿工程、矿物加工工程
东北大学第四轮学科评估
在教育部第四轮学科评估中，东北大学获得一个A和三个A-，没有A+学科入选。一个A是控制科学与工程，三个A-分别是网站工程，计算机科学与工程和材料科学。
B学科：哲学、化学、信息与通信工程、工商管理
B+学科：机械工程、生物工程、冶金工程、矿业工程、管理科学与工程、公共管理
B-学科：物理学、动力工程及工程热物理、土木工程、生物医学工程、安全科学与工程
C学科：生物学、力学、测绘科学与技术
C+学科：数学、电气工程、环境科学与工程
C-学科：化学工程与技术、地质资源与地质工程