平行志愿投档后也有退档风险。考生的体检、单科成绩、综合素质评价等因素不符合高校要求的，都有可能造成退档。这些因素由高校根据招生需要自主设定，并在高校招生章程中公布。退档考生不能再补投到后面的专业平行志愿，只能参加下一批次或征集志愿的志愿填报和投档。
平行志愿出现退档的原因
1、专业不服从调剂
近年来因不服从专业调剂而被退档的考生也是很多的，因为有的考生在填写志愿的时候会选择不服从调剂，那么在自己选择的专业被录满的时候，留给考生的只能是被院校退档。
2、相关科目分数不够
部分院校在招生的时候会对考生的某些相关科目的分数有要求，即使考生的总成绩达到要求，但是因为单科成绩不足可也能会被退档。所以考生在报考的时候一定要看好院校的招生简章，不要盲目选择。
3、身体条件不符
部分院校的专业对考生自身有条件限制，如身高、体重、听力、嗅觉、视力（色盲、色弱）等，如果不符合条件，一样会被退档。
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平行志愿填报时怎样避免退档
考生在填报前应充分了解和熟悉志愿填报中的常见概念、志愿填报和录取的相关政策、院校专业录取规则等内容。考生填报的志愿要设置合理，分层次选择高校。 志愿填报可以分为高中低三档：高档可以冲一下；中档选择符合自己的分数与情况的学校；低档填写稍微差一点的学校，防止意外出现。
另外，如果不是百分之百把握会被录取，可以选择服从调剂。只要在填报志愿时，注明专业服从调剂，分数达到提档线，学校基本上不退档。实行平行志愿后，投档到高校的考生分数将扁平化，被录取考生之间的分数更为接近，集中在一个较小的分数段内。
因此，重点院校的热门专业竞争加剧。如果考生注明专业服从调剂，学校会为考生选择与其所选专业较为接近的专业进行调剂。