南京农业大学王牌专业有作物学、植物保护、农业资源利用、兽医学、食品科学、科学技术史、畜牧学、公共管理等。
南京农业大学坐落于虎踞龙蟠的古都南京，是一所以农业科学与生命科学为优势和特色，农、理、经、管、工、文、法学多学科协调发展的教育部直属全国重点大学，是国家“双一流”、“211工程”、“985工程优势学科创新平台”重点建设高校。
南京农业大学有32个硕士授权一级学科、15种专业学位授予权、17个博士授权一级学科和15个博士后科研流动站；学校还拥有作物学、农业资源利用、植物保护和兽医学等4个一级学科国家重点学科，蔬菜学、农业经济管理和土地资源管理等3个二级学科国家重点学科，食品科学被列为国家重点（培育）学科，有8个学科进入江苏高校优势学科建设工程，7个学科入选国家高等学校学科创新引智基地（111计划）。
一级学科国家重点学科：作物学、植物保护、农业资源利用、兽医学。
二级学科国家重点学科：蔬菜学、农业经济管理、土地资源管理。
国家重点（培育）学科：食品科学。
十二五期间一级学科省重点学科：科学技术史、畜牧学、公共管理、生态学、草学。
二级学科省重点学科：植物学、微生物学、科学技术史、食品科学、果树学、植物营养学、动物营养与饲料科学、基础兽医学、临床兽医学、土地资源与管理、生物信息学、农村发展、植物检疫与生物安全、农业信息学。
江苏高校优势学科建设工程：作物学、植物保护、农业资源与环境、兽医学、食品科学与工程、农林经济管理、现代园艺科学、农业信息学。